Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms