Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms