Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
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