Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ColqO35348 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ColqO35348 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ColqO35348 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ColqO35348 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ColqO35348 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ColqO35348 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ColqO35348 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ColqO35348 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ColqO35348 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ColqO35348 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Arhgef38-204ENSMUST00000161932 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm26706-201ENSMUST00000180718 746 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm43815-201ENSMUST00000197676 990 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gap43-201ENSMUST00000102817 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ColqO35348 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ColqO35348 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ColqO35348 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ColqO35348 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ColqO35348 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ColqO35348 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ColqO35348 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ColqO35348 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms