Protein–RNA interactions for Protein: O35199

Vmn2r89, Putative pheromone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r89O35199 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn2r89O35199 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms