Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms