Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Degs1O09005 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Degs1O09005 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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