Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm8888J3QPX5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm8888J3QPX5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm8888J3QPX5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm8888J3QPX5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm8888J3QPX5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gm8888J3QPX5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gm8888J3QPX5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gm8888J3QPX5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms