Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms