Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms