Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm21897J3KMP5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm21897J3KMP5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21897J3KMP5 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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