Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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