Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Tcf7l2-208ENSMUST00000111654 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20517G3UVU6 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Sox5-205ENSMUST00000111749 3879 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20517G3UVU6 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms