Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms