Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ttc17E9PVB5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ttc17E9PVB5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ttc17E9PVB5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ttc17E9PVB5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc17E9PVB5 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms