Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gcn1E9PVA8 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm25735-201ENSMUST00000175164 215 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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