Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms