Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms