Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms