Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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