Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Usf3B2RUQ2 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms