Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms