Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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