Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms