Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms