Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Odf2A3KGV1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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