Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms