Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd1A2AKB4 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd1A2AKB4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms