Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Lcn6A2AJB9 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Lcn6A2AJB9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Lcn6A2AJB9 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Lcn6A2AJB9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Lcn6A2AJB9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Lcn6A2AJB9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Lcn6A2AJB9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn6A2AJB9 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms