Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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PtprfA2A8L5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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PtprfA2A8L5 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms