Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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