Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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