Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Cldn6Q9Z262 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Cldn6Q9Z262 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Cldn6Q9Z262 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Cldn6Q9Z262 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Cldn6Q9Z262 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Cldn6Q9Z262 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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Cldn6Q9Z262 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Cldn6Q9Z262 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Cldn6Q9Z262 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Cldn6Q9Z262 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Cldn6Q9Z262 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Cldn6Q9Z262 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Cldn6Q9Z262 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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