Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms