Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203.8 ms