Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms