Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nek3Q9R0A5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms