Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms