Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms