Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms