Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms