Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms