Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms