Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms