Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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FancaQ9JL70 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FancaQ9JL70 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FancaQ9JL70 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FancaQ9JL70 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FancaQ9JL70 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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FancaQ9JL70 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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FancaQ9JL70 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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FancaQ9JL70 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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FancaQ9JL70 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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FancaQ9JL70 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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FancaQ9JL70 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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FancaQ9JL70 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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FancaQ9JL70 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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FancaQ9JL70 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FancaQ9JL70 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FancaQ9JL70 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms