Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms