Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Riox1Q9JJF3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Riox1Q9JJF3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Riox1Q9JJF3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Riox1Q9JJF3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Riox1Q9JJF3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Riox1Q9JJF3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Riox1Q9JJF3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riox1Q9JJF3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms