Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Ube3bQ9ES34 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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