Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Irx6Q9ER75 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Irx6Q9ER75 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Irx6Q9ER75 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Irx6Q9ER75 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Irx6Q9ER75 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Irx6Q9ER75 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Irx6Q9ER75 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms