Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms